Studijní možnosti na Gymnáziu F. X. Šaldy jsou rozmanité. Jsou přijímáni žáci po 5. třídě ZŠ na osmileté studium, žáci po 7. třídě ZŠ na šestileté dvojjazyčné studium a žáci po 9. třídě ZŠ na čtyřleté studium. Studium je vždy zakončeno maturitou. Studenti čtyřletého studia si mohou zvolit buď humanitní, nebo přírodovědné zaměření, a výběrem volitelných předmětů v posledních dvou letech studia ještě posílit ty obory, o které se zajímají. Osmileté studium je prvních šest let charakterizováno jako všeobecné, ale poslední dva roky studia mají studenti také možnost výběrem volitelných předmětů rozhodnout o svém studijním zaměření.

O dobré úrovni výuky na Gymnáziu F. X. Šaldy svědčí i vysoké počty přijatých studentů na vysoké školy. Ze všech zájemců o vysokoškolské studium je to téměř 90% přijatých.